Peer reviewed papers

Rogue H, Miège C, Bonnineau C, Daval A, Depret G, Susset L, Tardy V, Lyautey E, Devers M, Pesce S., 2025. Sulfamethazine biodegradation in sediments is driven by chronic exposure concentrations. Ecotoxicol Environ Saf. 303:118785. https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2025.118785

Intership reports

• Erine SEGHERS - Master 2 For The Microbes (international master in microbiology). Cultured-based detection of antibiotic resistant pathogens from a river periphyton, Université de Bourgogne Franche-Comté.
• Louis SUSSET - Master 2 Microbiologie Environnement Santé. Effets de l’exposition chronique aux substances pharmaceutiques sur la structure et la diversité des communautés microbiennes. Sorbonne Université – Muséum National d’Histoire Naturelle - https://hal.inrae.fr/hal-05218361
• Aline THIERRY - Master 2 Chimie de l’Environnement et de l’Écologie Chimique. Étude de la répartition de la contamination des rivières par les substances pharmaceutiques et de la bioaccumulation dans le périphyton in situ. Université de Perpignan Via Domitia - https://hal.inrae.fr/hal-05218364
• Darnika SELVESWARAN- Master 2 Microbiologie Environnement Santé. Effets de substances pharmaceutiques, seules ou en mélanges, sur des communautés microbiennes périphytiques naturelles. Sorbonne Université – Muséum National d’Histoire Naturelle
• Lilou DESHAYES - Master 2 Biotechnologies - Biomolécules, Microorganismes, Bioressources. Effets de l’exposition chronique à trois substances pharmaceutiques : ofloxacine, diclofénac et sulfaméthazine au cours du temps et à différentes concentrations sur la structure et la diversité des bactéries et des diatomées au sein de biofilms de rivière – Université Bretagne Sud
• Jolan SALLOUM - Master1 Microbiologie. Détection de bactéries résistantes aux antibiotiques dans les sédiments et périphyton de la rivière Tillet, Université de Lorraine.
• Léa PIRSCH - Licence Professionnelle Industries Pharmaceutiques, Cosmétologiques et de Santé – Projet tutoré (2 mois), Détection de bactéries résistantes aux antibiotiques dans l’environnement, Université de Bourgogne.

Oral presentations at national and international congresses or webinars

• PESCE S., 2025. Pathways of Antimicrobial Resistance and Pathogens: Exploring the Land–Water Interface in Aquatic Ecosystems. Bioaqua COST Action Webinar series. 21 Octobre 2025 (invited conference)
• PESCE S., 2024. Adaptation des microorganismes à la contamination environnementale par les substances pharmaceutiques: quelles conséquences sur la dispersion de l'antibiorésistance dans les écosystèmes? Journées de Neurologie de Langue Française. Paris, 9 avril 2024 (invited conference)
• PESCE S., 2023. Adaptation des communautés microbiennes à la pression chimique dans les cours d’eau: Perspectives scientifiques et opérationnelles. Société Française de Microbiologie. Webinaire Section Microbiologie Environnementale : Résistance et Adaptation, 23 mars 2023 (invited conference)

Posters at national and international congresses

• SELVESWARAN D, MIÈGE C, CHAPUIS T, DAVAL A, KERGOAT L, MOTTE B, ROSY C, TARDY V, VOLAT B, PESCE S, 2025. Réponses fonctionnelles et acquisition de tolérance de communautés périphytiques à un mélange de substances pharmaceutiques. 12ème colloque de l'Association Francophone d'Écologie Microbienne (Beaune, France). 18-21 novembre 2025.
• BARBIER E, DEPRET G, KERGOAT L, MAGALLON A, SEGHERS E, ROCHELET M, HARTMANN A, PESCE S, AMOUREUX L, 2025. Diversité des entérobactéries résistantes aux antibiotiques de la classe des céphalosporines de 3e génération dans les sédiments, périphyton et eau d’une rivière urbaine : Le Tillet (Aix-les-Bains, France). 12ème colloque de l'Association Francophone d'Écologie Microbienne (Beaune, France). 18-21 novembre 2025
• BARBIER E, DEPRET G, KERGOAT L, MAGALLON A, SEGHERS E, ROCHELET M, HARTMANN A, PESCE S, AMOUREUX L, 2025. Diversité des entérobactéries résistantes aux antibiotiques de la classe des céphalosporines de 3e génération dans les sédiments, périphyton et eau d’une rivière urbaine : Le Tillet (Aix-les-Bains, France). Symposium HARMI (Dole, France). 22-23 septembre 2025.
• ROGUE H, SUSSET L, BONNINEAU C, CHAPUIS T, DAVAL A, LYAUTEY E, MOTTE B, ROSY C, VOLAT B, MIEGE C, PESCE S, 2024. Experimental assessment of the chronic exposure thresholds to pharmaceuticals that can impact sediment microbial community diversity, activities and antibiotic tolerance. 4th International Conference on Microbial Ecotoxicology, EcotoxicoMic2024. Gothenburg,(Sweden), 12-14 novembre 2024
• THIERY A, ROGUE H, DAVAL A, CHAPUIS T, ROSY C, SUSSET L, PESCE S, MIEGE C, 2024. Influence of periphytic biofilm growth stage on the in situ bioaccumulation of pharmaceuticals. International Congress in Ecology & Evolution, SFE² (Lyon, France). 21-25 Octobre 2024

Oral presentations at internal meetings

• PESCE S., 2023. Adaptation des communautés microbiennes aquatiques à la contamination par les résidus médicamenteux: Quels risques pour la santé ? Assemblée générale du GRAIE. Villeurbanne, 10 mai 2023
• ROGUE H., 2024. Exposition des communautés microbiennes périphytiques et sédimentaires aux substances pharmaceutiques dans des petits cours d’eau et réponses adaptatives associées. Journées de thèses de l’UR RiverLy. Villeurbanne, 2 mai 2024.

Outreach event

• KERGOAT L., ROGUE H., 2024. Les écosystèmes des rivières : victimes collatérales de notre consommation de médicaments. Soirée Pint of Science « De la pinte à la rivière ». Valence, 15 mai 2024.